MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 51250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014507	TCT	2	6	28806	28811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352192
502	NC_014507	GGC	2	6	28950	28955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352192
503	NC_014507	GGA	2	6	29046	29051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352192
504	NC_014507	TATTG	2	10	29090	29099	20 %	60 %	20 %	0 %	307352192
505	NC_014507	TCG	2	6	29130	29135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352192
506	NC_014507	A	7	7	29162	29168	100 %	0 %	0 %	0 %	307352192
507	NC_014507	GGC	2	6	29246	29251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352192
508	NC_014507	ACC	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352192
509	NC_014507	GATC	2	8	29594	29601	25 %	25 %	25 %	25 %	307352192
510	NC_014507	CTT	2	6	29641	29646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352192
511	NC_014507	CGG	2	6	29711	29716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352192
512	NC_014507	GAG	2	6	29763	29768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352192
513	NC_014507	CTG	2	6	29772	29777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352192
514	NC_014507	AAAGG	2	10	29828	29837	60 %	0 %	40 %	0 %	307352192
515	NC_014507	AGG	2	6	29879	29884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352192
516	NC_014507	CGT	2	6	29896	29901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352192
517	NC_014507	TG	3	6	29958	29963	0 %	50 %	50 %	0 %	307352192
518	NC_014507	AAG	2	6	30003	30008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352192
519	NC_014507	GAA	2	6	30035	30040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352192
520	NC_014507	TCGAT	2	10	30115	30124	20 %	40 %	20 %	20 %	307352192
521	NC_014507	ACG	2	6	30130	30135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352192
522	NC_014507	TAT	2	6	30138	30143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352192
523	NC_014507	GGT	2	6	30185	30190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352192
524	NC_014507	TC	4	8	30242	30249	0 %	50 %	0 %	50 %	307352192
525	NC_014507	TA	3	6	30447	30452	50 %	50 %	0 %	0 %	307352192
526	NC_014507	GAG	2	6	30462	30467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352192
527	NC_014507	CGA	2	6	30482	30487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352192
528	NC_014507	GATC	2	8	30512	30519	25 %	25 %	25 %	25 %	307352192
529	NC_014507	CGG	2	6	30638	30643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352192
530	NC_014507	GAG	2	6	30666	30671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352192
531	NC_014507	GAC	2	6	30713	30718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352192
532	NC_014507	ATTTT	2	10	30743	30752	20 %	80 %	0 %	0 %	307352192
533	NC_014507	AGG	2	6	30957	30962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352193
534	NC_014507	AGG	2	6	31129	31134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352193
535	NC_014507	GCCG	2	8	31171	31178	0 %	0 %	50 %	50 %	307352193
536	NC_014507	A	6	6	31188	31193	100 %	0 %	0 %	0 %	307352193
537	NC_014507	A	6	6	31255	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	307352194
538	NC_014507	TTG	2	6	31293	31298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352194
539	NC_014507	CAG	2	6	31330	31335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352194
540	NC_014507	TC	3	6	31447	31452	0 %	50 %	0 %	50 %	307352194
541	NC_014507	GCA	2	6	31463	31468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352194
542	NC_014507	TGT	2	6	31477	31482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352194
543	NC_014507	TGC	2	6	31507	31512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352194
544	NC_014507	AAT	2	6	31625	31630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352194
545	NC_014507	ACG	2	6	31709	31714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352194
546	NC_014507	CA	3	6	31718	31723	50 %	0 %	0 %	50 %	307352194
547	NC_014507	TTA	2	6	31747	31752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352194
548	NC_014507	AAG	2	6	31795	31800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352194
549	NC_014507	ATA	2	6	31884	31889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352194
550	NC_014507	AAC	2	6	31952	31957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352194
551	NC_014507	AAG	2	6	31994	31999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352194
552	NC_014507	ATT	2	6	32028	32033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352194
553	NC_014507	ACG	2	6	32034	32039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352194
554	NC_014507	CT	3	6	32094	32099	0 %	50 %	0 %	50 %	307352194
555	NC_014507	AGT	2	6	32105	32110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352194
556	NC_014507	GTC	2	6	32117	32122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352194
557	NC_014507	ATGCGA	2	12	32124	32135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307352194
558	NC_014507	GAA	2	6	32165	32170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352194
559	NC_014507	GGA	2	6	32224	32229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352194
560	NC_014507	AT	3	6	32257	32262	50 %	50 %	0 %	0 %	307352194
561	NC_014507	CTG	2	6	32274	32279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352194
562	NC_014507	TTG	2	6	32301	32306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352194
563	NC_014507	AGG	2	6	32326	32331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352194
564	NC_014507	TTC	2	6	32354	32359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352194
565	NC_014507	TTAT	2	8	32380	32387	25 %	75 %	0 %	0 %	307352194
566	NC_014507	CCT	2	6	32397	32402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352194
567	NC_014507	TGA	2	6	32455	32460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352194
568	NC_014507	TTG	3	9	32520	32528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352194
569	NC_014507	A	7	7	33104	33110	100 %	0 %	0 %	0 %	307352195
570	NC_014507	TAT	3	9	33149	33157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352195
571	NC_014507	TGA	2	6	33167	33172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352195
572	NC_014507	TTC	3	9	33240	33248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352195
573	NC_014507	TCT	2	6	33532	33537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352195
574	NC_014507	TGACGG	2	12	33588	33599	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307352195
575	NC_014507	TGA	2	6	33708	33713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352195
576	NC_014507	GCA	2	6	33886	33891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
577	NC_014507	TGATGG	2	12	33909	33920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307352195
578	NC_014507	ACCT	2	8	34023	34030	25 %	25 %	0 %	50 %	307352195
579	NC_014507	TGGTGA	2	12	34104	34115	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307352195
580	NC_014507	CAC	2	6	34116	34121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352195
581	NC_014507	TC	3	6	34323	34328	0 %	50 %	0 %	50 %	307352195
582	NC_014507	A	6	6	34389	34394	100 %	0 %	0 %	0 %	307352195
583	NC_014507	CGGC	2	8	34418	34425	0 %	0 %	50 %	50 %	307352195
584	NC_014507	ACCT	2	8	34536	34543	25 %	25 %	0 %	50 %	307352195
585	NC_014507	ACT	2	6	34630	34635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352195
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588	NC_014507	CAACA	2	10	34898	34907	60 %	0 %	0 %	40 %	307352195
589	NC_014507	CTT	2	6	35048	35053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352195
590	NC_014507	CAC	2	6	35055	35060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352195
591	NC_014507	CTC	2	6	35064	35069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352195
592	NC_014507	GGA	2	6	35152	35157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352195
593	NC_014507	ACCGG	2	10	35227	35236	20 %	0 %	40 %	40 %	307352195
594	NC_014507	ACC	2	6	35317	35322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352195
595	NC_014507	GTATC	2	10	35333	35342	20 %	40 %	20 %	20 %	307352195
596	NC_014507	CGG	2	6	35343	35348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352195
597	NC_014507	ATGG	2	8	35464	35471	25 %	25 %	50 %	0 %	307352195
598	NC_014507	ACG	2	6	35473	35478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
599	NC_014507	CCTG	2	8	35572	35579	0 %	25 %	25 %	50 %	307352195
600	NC_014507	AGG	3	9	35676	35684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352195
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602	NC_014507	AAGAT	2	10	35741	35750	60 %	20 %	20 %	0 %	307352195
603	NC_014507	CAA	2	6	35813	35818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352195
604	NC_014507	AT	3	6	35869	35874	50 %	50 %	0 %	0 %	307352195
605	NC_014507	TA	3	6	35894	35899	50 %	50 %	0 %	0 %	307352195
606	NC_014507	GTG	2	6	35942	35947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352195
607	NC_014507	ACG	2	6	35960	35965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
608	NC_014507	GGACA	2	10	35995	36004	40 %	0 %	40 %	20 %	307352195
609	NC_014507	CCCCT	2	10	36140	36149	0 %	20 %	0 %	80 %	307352195
610	NC_014507	TCCTGG	2	12	36190	36201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352195
611	NC_014507	GAA	2	6	36313	36318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352195
612	NC_014507	AGC	2	6	36322	36327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
613	NC_014507	GTT	2	6	36376	36381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352195
614	NC_014507	CAG	2	6	36390	36395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
615	NC_014507	CGG	2	6	36447	36452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352195
616	NC_014507	GATC	2	8	36477	36484	25 %	25 %	25 %	25 %	307352195
617	NC_014507	ACA	2	6	36520	36525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352195
618	NC_014507	CT	3	6	36531	36536	0 %	50 %	0 %	50 %	307352195
619	NC_014507	GCG	2	6	36542	36547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352195
620	NC_014507	GAAG	2	8	36592	36599	50 %	0 %	50 %	0 %	307352195
621	NC_014507	GTC	2	6	36619	36624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352195
622	NC_014507	ACA	2	6	36632	36637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352195
623	NC_014507	CGA	2	6	36651	36656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
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625	NC_014507	AAGGC	2	10	36710	36719	40 %	0 %	40 %	20 %	307352195
626	NC_014507	GCA	2	6	36737	36742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352195
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628	NC_014507	AGG	2	6	36825	36830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352195
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